Il n'aura passé qu'une saison sous les couleurs de l'AS Monaco mais quelle saison ! Débarqué à l'été 2003 en provenance du Real Madrid Fernando Morientes ne tarde pas à s'imposer. Attaquant habile, fin techniquement, mais surtout redoutable finisseur, le natif de Cilleros dispute 28 rencontres de Ligue 1 et inscrit dix buts, contribuant ainsi largement à la belle troisième place des Monégasques à l'issue de la saison 2003-2004. Mais c'est surtout en Ligue des Champions que "Nando" forge sa légende. décide d’écrire son histoire et un chapitre de celle de l’AS Monaco. Aux côtés de Ludovic Giuly, Jérôme Rothen, et sous les commandes de Didier Deschamps, il participe à l’épopée historique des Monégasques qui se hisseront en finale (2003-2004). À lui seul, l’Espagnol inscrit 9 buts dans la compétition et termine meilleur buteur, inscrivant notamment deux buts lors du quart de finale de légende face au... Real Madrid.